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El consejo directivo es el órgano de gobierno de la Escuela de Ciencias Agrarias, Naturales y Ambientales cuyas funciones se detallan a continuación:

• Velar por la aplicación del Estatuto Universitario y la legislación universitaria . Además ejercer la jurisdicción contenciosa y disciplinaria dentro del ámbito de la Escuela. Dictar y modificar su reglamento interno.
• Elegir al director y vicedirector, como así conceder licencias a los miembros del mismo. Remover o suspender a sus miembros por causas notorias de inconducta, incapacidad, incumplimiento de sus deberes debidamente acreditados, o por estar procesado por delito. A tal efecto se requerirá de por lo menos dos tercios de los miembros del Consejo en la sesión especial que se convocará al efecto.
• Organizar la oferta académica de pregrado y grado, como así elevar al Consejo Superior los planes de estudios pertinentes a las carreras para su aprobación. Además de aprobar los programas de estudios de las asignaturas. Por ultimo elevar los informes que éste requiera.
• Determinar las fechas en las que se constituyan las mesas examinadoras.
• Fomentar la investigación, la extensión universitaria y la capacitación y formación docente.
• Proponer al Consejo Superior la iniciación de juicio académico de conformidad con lo que se establezca la reglamentación que a tal fin dicte el Consejo Superior.
• Aprobar o suspender las medidas tomadas por el Director en algunos casos específicos. Considerar el informe anual presentado por el Director sobre la labor realizada tanto en la actuación como desempeño de la Escuela.
• Presentar al Rector para su tratamiento en el Consejo Superior, el proyecto de Presupuesto de la Escuela y sus modificaciones.