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Mejoramiento molecular y selección genómica en plantas

Organizan:

Universidad Naional de Lomas de Zamora, Facultad de Cs Agrarias
Academia Nacional de Agronomía y Veterinaria (ANAV)

DOCENTES

Guillermo Eyhérabide
César López
Docentes invitados
Antonio Díaz Paleo
Teresa Boca

DESTINATARIOS

Profesionales dedicados al mejoramiento genético vegetal e interesados en la temática

REQUISITOS

Título Universitario

FUNDAMENTACIÓN

La creciente disponibilidad de técnicas de genotipificación automatizadas y de alta procesividad viene ampliando las oportunidades de su aplicación en mejoramiento genético vegetal. Las aplicaciones cubren un amplio espectro de posibilidades, desde la búsqueda e identificación de QTLs asociados a características de interés agronómico, hasta el uso de tal conocimiento en programas de selección y desarrollo de nuevos genotipos promisorios.
El curso pretende considerar los principales aspectos conceptuales en los que se basa el mejoramiento molecular, describirlos y analizar su implementación en situaciones reales o simuladas, a fin de contar con elementos para analizar críticamente su aplicación en programas de mejoramiento.

OBJETIVOS

  • Contribuir al conocimiento sobre la aplicación de técnicas de mejoramiento molecular en general, y de selección genómica en particular
  • Analizar sus ventajas, limitaciones e integración en programas aplicados de mejoramiento de especies vegetales.

PROGRAMA

Módulo 1.  Introductorio.
Docentes: Guillermo Eyherabide, César López, Antonio Díaz Paleo, Teresa Boca
Conceptos básicos de Genética Cuantitativa.
Tipo de marcadores moleculares. Desequilibrio de ligamiento. Aplicación de marcadores moleculares en mejoramiento genético vegetal. Enfoque bayesiano y frecuentista.
Módulo 2. Selección asistida por marcadores moleculares.
Docente: César López
Selección asistida con marcadores moleculares. Ligamiento y desequilibrio de ligamiento. Mapa genético. Tipos de poblaciones biparentales utilizadas. Análisis de QTLs por marcador simple. Análisis de QTLs por intervalos simple y compuesto.. Bulk Segregant Analysis. Ejercitación con software
Módulo 3. Mapeo por asociación.
Docente: Antonio Díaz Paleo y Teresa Boca
Mapeo por asociación. Diferencias entre mapeo por asociación y mapeo biparental. Cuantificación del desequilibrio de ligamiento y disminución por generaciones y distancia cromosómica. Factores genéticos y demográficos que inciden en el desequilibrio de ligamiento. Frecuencia y distribución de SNPs en especies de plantas. FDR. Diseños experimentales y potencia de tests Inferencia de estructura poblacional y parentesco a travé de marcadores moleculares. Validación de marcadores moleculares. Práctica con STRUCTURE, TASSEL y SPAGeDI
Módulo 4. Selección genómica.
Docentes Guillermo Eyhérabide y Teresa Boca
Generalidades sobre Selección Recurrente Asistida por Marcadores y Selección Genómica. Modelo genético. Población de entrenamiento y población candidata. Métodos de predicción del valor de mejora genómico. Paramétricos y no paramétricos. Precisión y factores que la afectan. Asignación de recursos. Respuesta a la selección genómica. Ejemplos de aplicación. Simulaciones y resultados empíricos en especies anuales y perennes de interés agronómico. Práctica de modelos de estimación genómica del valor de mejora  (GPLUP, Bayes A, Bayes B, RKHS)

BIBLIOGRAFÍA

Se analizarán trabajos publicados en revistas de la especialidad. A modo de ejemplo se citan a continuación sólo cuatro publicaciones:
– Dekkers, J.C.M. 2007 Prediction of response to marker-assisted and genomic selection using selection index theory. J. Anim. Breed. Genet. 124:331-341
– Heffner, E.L., Lorenz, A.J, Jannink, J.L., Sorrells, M.E. 2010. Plant breeding with genomic selection: gain per unit time and cost. Crop Sci. 50:1681-1690.
– Iwata, H., Jannink, J.L. 2011. Accuracy of genomic selection prediction in barley breeding programs: a simulation study based on the real single nucleotide polymorphism data of barley breeding lines. Crop Sci. 51:1915-1927
– Jannink, J.L., Lorenz A.J., Iwata, H. 2010. Genomic selection in plant breeding: from theory to practice. Briefings in Functional Genomics. Vol 9 (2):166-177

CARGA HORARIA

50 horas

CRONOGRAMA DE ACTIVIDADES

Inicio: viernes 24 de octubre de 2014.
Módulo 1: Viernes 24 de octubre (teórico) | Módulo 2: Viernes 31 de octubre (teórico-práctico) | Módulo 3: Viernes 7 de noviembre (teórico) y sábado 8 de noviembre (práctico) | Módulo 4: Viernes 14 de noviembre (teórico) y sábado 15 de noviembre (práctico)
Lugar de dictado:
Módulos 1 y 2: Sede Buenos Aires de UNNOBA. Av. Callao 289- 3º Piso
Módulos 3 y 4: Escuela de Cs. Agrarias, Naturales y Ambientales de la UNNOBA. Av. Pte. Dr. Arturo Frondizi 2650, Pergamino, Buenos Aires (Ruta 32 Km 3,7)

MODALIDAD DEL CURSO

Presencial. Siete clases presenciales (cuatro clases teóricas, una clase teórico-práctica y dos clases prácticas) y envío de examen final.
Las clases prácticas comprenden ejercicios de aplicación en computadora, prácticas de laboratorio de marcadores moleculares, y lectura de artículos recientes sobre los contenidos del curso

MODALIDAD DE EVALUACIÓN

Examen escrito (“take home exam”)

INFORMES

Por mail a: cursosposgrado@unnoba.edu.ar
Teléfonos: 02477-409500 (interno 21201) – Pergamino | 0236-4407750 (interno 12500) – Junín