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Tecnologías biológicas de high-throughput

DOCENTE RESPONSABLE

Dr. Mariano Belaich

DESTINATARIOS

Profesionales que provengan de diversas disciplinas: Biotecnología, Biología, Bioquímica, Biofísica, Veterinaria, Agronomía, Medicina, Física, Matemática, Informática, Computación, y otras disciplinas afines

REQUISITOS

Título universitario o de nivel superior no universitario de cuatro años de duración como mínimo.

OBJETIVO

Adquirir conocimiento de las tecnologías de high-throughput vinculadas con el universo de la genómica, transcriptómica y proteómica.

PROGRAMA

Unidad 1. Constitución molecular de la materia viva. Niveles de la información biológica y su flujo. La célula procariota y eucariota. Biodiversidad. El moviloma. Evolución de las especies. Ingeniería Genética: definiciones y contexto histórico. Aplicaciones en biotecnología y biología sintética.

Unidad 2. Genómica y epigenómica. Contenido informativo en los genomas y reglas de composición. Epigenoma. Proyectos Genomas. Tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS). Aplicaciones en secuenciación de novo y en resecuenciación. Variabilidad genómica e hibridación en microarreglos. Aplicaciones en epigenómica.

Unidad 3. Transcriptómica. El gen como elemento funcional del ADN. Maquinarias de transcripción. Transcriptoma celular y clasificación de los ARN de acuerdo con su función. Proyecto ENCODE. Secuenciación de ARN mediante tecnologías de nueva generación (NGS). Hibridación en microarreglos.

Unidad 4. Proteómica. El proteoma celular. Criterios de abordaje en función de su localización celular y/o de sus propiedades fisicoquímicas. Técnicas de fraccionamiento. Electroforesis bidimensional on-gel y off-gel. Espectroscopía de masas.

Unidad 5. Interactómica. Sistemas biológicos. Tecnologías para revelar interacciones entre ácidos nucleicos. Tecnologías para revelar interacciones entre ácidos nucleicos y proteínas. Tecnologías para revelar interacciones entre proteínas.

BIBLIOGRAFIA

  • Margulis L, Chapman J. 2009. Kinngdom and Domains. An illustrated guide to the phyla of life on earth.  Michael J. Chapman — 4th ed.
  • Frese KS, Katus HA and Meder B. 2013. Next-Generation Sequencing: From Understanding Biology to Personalized Medicine. Biology, 2, 378-398.
  • Myllykangas S, Buenrostro J, Ji HP. 2012. Overview of Sequencing Technology Platforms. Capítulo 2, en N. Rodríguez-Ezpeleta et al. (eds.), Bioinformatics for High Throughput Sequencing.
  • Illumina Inc. 2012. An Introduction to Next-Generation Sequencing Technology.
  • López M, Mallorquín P. y Vega M. 2002. Microarrays y biochips de AND. Genoma España, Salud humana. Fundación española para el desarrollo en la investigación en genómica y proteómica.  
  • Gerstein MB, Bruce C., Rozowsky JS, et al. 2007. What is a gene, post-ENCODE? History and updated definition. 17: 669-681 Genome Res. 
  • Marioni JC, Stephens M, Mason CE, et al. 2008. RNA-seq: An assessment of technical reproducibility and comparison with gene expression arrays. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 18:1509–1517.
  • Wang Z, Gerstein M and SnyderM. 2009. RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics. Nature Reviews. Genetics. 10: 57-63.
  • Malone JH, Oliver B. 2011. Microarrays, deep sequencing and the true measure of the transcriptome. BMC Biol. 9:34.
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  • Michel PE, Reymond F, Arnaud IL, et al. 2003. Protein fractionation in a multicompartment device using Off-Gel isoelectric focusing. Electrophoresis. 24(1-2):3-11.
  • Miyamoto-Sato E, Ishizaka M, Horisawa K, et al. 2005. Cell-free cotranslation and selection using in vitro virus for high-throughput analysis of protein-protein interactions and complexes. Genome Res. 15(5):710-7.
  • Stynen B, Tournu H, Tavernier J, Van Dijck P. 2012. Diversity in genetic in vivo methods for protein-protein interaction studies: from the yeast two-hybrid system to the mammalian split-luciferase system. Microbiol Mol Biol Rev. 76(2):331-82.
  • Bittencourt D, Auboeuf D. 2012. Capítulo 36. Analysis of Co-transcriptional RNA Processing by RNA-ChIP Assay. Ales Vancura (ed.), Transcriptional Regulation: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, vol. 809, Springer Science+Business Media.

Como soporte bibliográfico para todas las unidades también se utilizarán artículos científicos que relaten casos de interés y material técnico producido por las empresas que comercializan las tecnologías en estudio. Además, se aportará material didáctico generado ad hoc para cada una de las clases.

CARGA HORARIA

36 horas.

CRONOGRAMA DE ACTIVIDADES

Inicio: viernes 25 de octubre
Los días: 25 y 26 de octubre; 1, 2, 15 y 16 de noviembre.
Horario: los viernes de 14 a 20 y sábados de 8:30 a 12:30 horas.
Lugar de dictado: Monteagudo 2772, Pergamino.

Evaluación

Examen teórico y práctico integrador al término del curso, apuntando a evaluar el dominio de los conceptos básicos del mismo

ARANCELES

  • Profesionales en General: $ 5.000
  • Graduados, Docentes y No Docentes UNNOBA: $ 4.000

INFORMES

Por mail a: cursosposgrado@unnoba.edu.ar
Teléfonos: 2477-409500 (interno 21201) – Sede Pergamino | 236-4407750 (interno 12502/12500) – Sede Junín